密西根大學綜合癌症中心的研究者們最近對人類基因組中沒有被詳細研究過的長鏈非編碼RNA （lncRNAs）進行了全面分析。他們發現lncRNAs可能在癌症中扮演很重要的角色,深入研究lncRNAs將會找到有利於癌症診斷,預後和治療的新標記物。
LncRNAs在基因組研究領域很長一段時間以來都沒有被深入研究。而近幾年,這些非編碼的RNA卻越來越引起大家的注意。密西根大學的這群研究者們利用了25個獨立的數據集,集合了7,526個RNA 序列樣品,利用了高通量RNA測序技術,確認了在正常組織和一些常見的癌症組織里超過58,000個lncRNA 基因。他們收集到這些在各種正常組織和癌症組織的基因組圖的數據,就如同打開了潘多拉的魔盒,將會有大批各種lncRNA作為新的生物標記物,會被分析並深入的學習。
研究者同時在這些lncRNAs中確認了一種lncRNA-SChLAP1,可以作為侵襲性前列腺癌的新的腫瘤標記物。SChLAP1主要發現在前列腺癌細胞,在其他癌細胞或者正常細胞類型里卻沒有。更重要的是它在轉移性的前列腺癌里的表達量比早期癌高很多。如果將來有方法能簡單定量檢測SChLAP1,就能為制定早期前列腺癌的治療方案提供很重要的參考依據。
研究者表示,相比較於編碼蛋白的基因,有些lncRNAs在腫瘤里是很精確而特異的表達的,這個特點讓lncRNAs成為新的腫瘤標記物非常有希望。儘管可能只有小部分的lncRNAs有真正的功能,但是相信這部分lncRNAs在未來的腫瘤診斷和治療上會發揮重大的作用。
研究得到的完整的數據庫MiTranscriptome compendium,已經對公眾開放,網址是www.mitranscriptome.org。
