馬瑪內—電系霸主挑戰庫庫伊博士：創造阿羅拉聯盟!聘請四天王! 與馬睿因對戰。(阿羅拉地區的箱子開發人) 隊長-馬瑪內 考驗內容-打敗霸主寶可夢 第一題-選擇寶可夢中心 第二題-選擇洛托姆圖鑒 第三題-選擇蟲電寶 第四題-選擇霸主寶可夢（充電寶三段） 擊敗霸主寶可夢鍬農炮蟲後獲得電Z(小智啊，你和隊長一開始在一塊我就不說什麼!) 馬睿因給予主角鋼Z 回到馬利埃庭園，骷髏隊當著庫庫伊。古茲馬登場 擊敗古茲馬，獲得熾焰咆哮虎Z 前往11號道路。通向12號道路， 遇見哈普烏 騎乘裝置登陸重泥挽馬(可以走荒地) 中途遇見格拉吉歐和哈烏，格拉吉歐讓玩家保護好小星雲 卡噗村 得知卡噗村往上走是建設的聯盟。 往右走想乙太之家 幽靈隊長-阿塞蘿拉 從卡噗村往下走進入14號道路來到舊址 考驗內容-拍攝霸主寶可夢 寶可夢搜索鏡會在這裡變成幽靈專用結構 鬼斯 鬼斯通 耿鬼的 遇見順序 最後是霸主謎擬Q 從舊址出去，與阿塞蘿拉對話 獲得幽靈Z 再次回到乙太之家，骷髏隊在乙太之家門口出現。 與布林美麗對戰開始，阿塞蘿拉妹妹的貓鼬少被搶走 骷髏隊要求主角獨自去骷髏隊基地。 來到沙灘邊，遇見老人物越桔 騎乘裝置登陸巨牙鯊(噴射水面上的岩石) 到達16號道路前往魄鎮-骷髏隊基地 到達16號道路到達魄鎮，這裡已經荒廢了 (吐槽 骷髏隊PC收費10元) 骷髏隊基地密語 1.圍攻 2.具甲武者 3.向尾喵可哥 問確認麼 回答NO 繼續走遇見古茲瑪。擊敗後右邊寶箱拿到蟲Z 出門後遇見一個大叔 默丹 阿塞蘿拉過來接走了貓鼬少 回到乙太之家，莉莉艾不見了(被布林美麗抓了) 格拉吉歐沖了進來，知道莉莉艾不見又要開戰 為了阿羅拉的未來和格拉吉歐走 烏拉烏拉島 島嶼之王-默丹 勾魂眼，混混鱷，貓老大 勝利後獲得惡Z 到達乙太樂園先到達電梯去尋找莉莉艾 上樓遇見分部長紮奧博 對戰(格拉吉歐少爺) 下樓去秘密研究所 知道小星雲是UB 上樓被乙太財團的圍攻 戰鬥 然後電梯被鎖 繼續和紮奧博那邊戰鬥 進入大門發現都是骷髏隊，乙太基金會雇傭了骷髏隊 與骷髏隊隊員戰鬥 與古茲馬戰鬥 進入房間內 看到露莎米奈 幫助莉莉艾去救小星雲 與露莎米奈對戰 對戰後劇情發生，轉天，莉莉艾改變了自己 換裝 拿到太陽之笛 前往最後一個島 波尼島 到達波尼島遇見哈普烏的奶奶 騎乘裝置登陸怪力 前往彼岸遺跡 哈普烏變成島嶼女王 前往椰蛋樹之島 拿到月亮之笛 回到波尼島 前往祭壇 遇到骷髏隊 戰鬥 戰鬥結束後 布林美麗出場 劇情 布林美麗給予主角 毒Z 島嶼女王-哈普烏 大考驗開始 對戰 勝利後 獲得地Z前往祭壇前往祭壇 途中遇見隊長-茉莉 獲得妖精Z 到達祭壇 祭壇考驗開始! 霸主-杖尾鱗甲龍 獲得龍Z 到達月輪祭壇 莉莉艾與主角吹響太陽&月亮笛子 小星雲蛻變月神 前往究極空間與露莎米奈進行戰鬥 (對方全部寶可夢為霸主形態) 擊敗露莎米奈後回到月輪祭壇 與月神戰鬥。 島主默丹-大大考驗 阿羅拉聯盟成立! 前往阿羅拉聯盟，遇見格拉吉歐 與格拉吉歐對戰 到達聯盟門口 哈烏出現 對戰 繼續往前走 遇見庫庫伊博士 進入阿羅拉聯盟 (天王會使用Z招式) 四天王 格鬥-哈拉，岩石-里茲，幽靈-阿塞蘿拉，飛行-卡希麗 最後打完最後一個天王後，會有很長的劇情期間不能存檔，之後要抓卡噗鳴鳴，如果要刷性格的話，建議在打完最後一個天王之後，存檔。 寶可夢博士庫庫伊，打敗完庫庫伊，成為初代阿羅拉聯盟冠軍！ 
返回小鎮 舉行慶典 和老婆莉莉艾偷偷摸摸去戰爭遺跡 遇見卡噗鳴鳴。戰鬥，不能存檔，如果要刷性格的話，建議打死二周目在刷。 捕獲到卡噗鳴鳴 拿到卡噗Z 劇情不說了~ 大家自己體會吧~ 一周目完成~ 二周目首先在家裡起床 在房間裡撿到基格爾德的核心 出房間後 哈烏過來 獲得狙擊樹梟Z，西獅海壬Z 出門後拿到一張神奇卡片 要求玩家去阿卡拉島八號道路的汽車旅館 遇見帥哥和莉拉 莉拉是對UB的員警 莉拉的精靈基本等級60+：胡地（精神強念+真氣彈）夢妖魔（十字切+影子球）卡比獸（哈欠+泰山壓頂）鈕瑪拉（冰系技能+惡系技能）暴蠑螈（雷牙+火牙+龍爪） 前往波尼島，一直往右走，遇見德克希歐 德克希歐基本等級60+：太陽伊布（力量交換）河馬王（噴射火焰）雷丘（反射盾＋精神強念）巨金怪（瓦劈）胡地MEGA（真氣彈+精神強念） 勝利後獲得鍵石與胡地超級石 到達對戰樹門口 赤紅&青綠出現 對話後要求和一個人對戰 赤紅：皮卡丘 噴火龍 卡比獸 胡地 青綠：胡地 乘龍 水箭龜 椰蛋樹 風速狗 隆隆岩 骷髏隊來到利利小鎮的祭台 骷髏隊已經解散 來到乙太財團 進入研究區域 遇見碧珂 進入裡面 研究所 基因之楔，懲戒之壺，心之水滴獲得 來到保護區 格拉吉歐把屬性空還有全部屬性記憶碟都交給主角(性格可刷) 來到空間研究所 芭內特博士給予主角現形鏡 回到阿卡拉島 阿卡拉島八號道路遇見阿克羅馬直接給予主角蓋諾賽克特的卡帶 基格爾德（阿標）二周目可以獲得 基格爾德可刷性格 打敗GAME FREAK的森本可以獲得蛋符 全阿羅拉圖鑒（捕獲）可以找GAME FREAK的增田要閃符
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