1945年2月，卷土重来的麦克阿瑟率美军直逼马尼拉城下。日本第14方面军司令山下奉文大将下令马尼拉为不设防城市，但海军部队拒绝服从。在美军强攻马尼拉期间发生了持续达一个月之久的屠杀事件，直到2月23日，美国军队重新夺回马尼拉。
　　战后据统计，马尼拉围城期间，死亡的菲律宾人总数达10万人以上，平均每天有3000人遇害。考虑到美军攻城期间也动用了大量重武器，10万人中有一部分死于美日两军的交火。但大部分菲律宾人肯定是死于日军有组织的大屠杀。美军缴获了一份这样的日军命令：“杀死菲律宾人时，尽量集中在一个地方，采用节省弹药和人力的方式进行，尸体的处理很麻烦，应把尸体塞进预定烧掉或炸毁的房屋里，或扔进河里。”
　　在“马尼拉惨案”中，最残忍，最骇人听闻的是日军在圣保罗大学一次杀害994名菲律宾儿童。日军先在大学餐厅里摆放了一些点心，把孩子们哄骗进来。正当孩子们吃点心的时候，一个兽兵拉动了藏在灯架内的集束手榴弹，悬挂在儿童头顶的五盏枝型吊灯轰然一声巨响，屋顶掀开了，孩子们被炸得血肉横飞，没死的在奔跑中倒在了机枪的火舌下。
　　1945年2月4日-2月10日日军在巴石河南岸肆意奸淫屠杀，烧毁了教堂和图书馆，将避难所的3000名难民烧死，2月5日勒令城中男女分开排列街上，将男子用机关枪射杀，女子肆意强奸后射杀，来不及杀害的无辜百姓则用手榴弹爆炸，尸横遍地。
　　从1932年的平顶山惨案到1945年的马尼拉惨案，日本所谓的“大东亚共荣圈”是以屠杀开始而以屠杀终结。我们以为奥斯维辛已经是终极的残暴，但日本“蝗军”在亚洲的暴行时隔65年仍然在挑战着所有人承受力的极限。整个近代史上，我们找不到有哪一支军队这样广泛的制造和参与对平民的大屠杀。
　　这是一支近代史上最暴虐、最野蛮、最反人类的军队，这是一个被宗教狂热式的天皇崇拜武装起来的披着文明外衣，却活在前现代的民族。我们诅咒这支军队，我们也同样警惕产生这样一支军队的民族和文明土壤，因为屠杀是他们的常态。