3月12日是孙中山先生逝世91周年纪念日，台湾地区领导人马英九当天早上来到纪念馆，为孙中山先生铜像敬献花圈。台湾多个民间团体、政党在纪念馆举行集会，对孙中山先生表示敬仰、怀念，并现场高呼“反对台独”“两岸和平统一”等口号。这些政党、团体的主要负责人纷纷表示，在台湾人民心中，孙中山先生占据着非常重要的地位。很多民众也都到纪念馆瞻仰，不少大陆游客也来到纪念馆参观致意，并纷纷拍照留念。

不过，台湾岛内也出现“去孙中山化”的声音。有民进党的民意代表提案声称要废除悬挂孙中山遗像，而一贯标榜“台独”主张的政党“时代力量”则连声附和，还出现了孙中山雕像遭人泼漆的事件。对此，陪同马英九前往纪念馆致意的台湾地区立法机构原副负责人洪秀柱表示，“去孙中山化”的行为是“暴行”，是不智而违法的行为，缺少对孙中山先生应有的尊重。她说，历史需要传承而非否定，后人应发扬孙中山先生的精神，而不是污蔑、诋毁他的贡献。

孙中山博爱基金会台湾分会在宜兰正式成立并举行揭牌仪式。分会会长、台湾商工统一促进会主席吴义德表示，未来的台湾地区领导人须秉持以往的合作精神，让两岸的和平红利继续释放，避免台湾经济遭受冲击。他认为，台湾不应该“去孙中山化”，而是要把孙中山的博爱精神传承给下一代。