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拙劣的甩鍋
   


中疾控官員的拙劣甩鍋。
直言簡評,2020-06-26.。  網頁鏈接

今日新聞介紹大陸官媒報道說,中國疾控中心26日在官網公布的文獻提到,北京本次疫情流行的新冠病毒為L基因型歐洲家系分支Ⅰ,排除動物病毒外溢和武漢流行毒株導致的可能性。#

簡評:中疾控官員試圖【甩鍋】甩給捷克,理由是其所謂【北京本次疫情流行的新冠病毒為L基因型歐洲家系分支Ⅰ】。那個甩鍋做法很拙劣,其實進一步說明病毒病源就是中國大陸。

中疾控所謂L-基因之類說法的依據,是有人發現新冠病毒S-基因蛋白614位點發生D為G的變化,俗稱【D614G】的變異或突變。根據這個變異,一些人把新冠病毒分為L-型和S-型;中疾控則將其劃分為中國本土型和所謂【外來】【輸入型】的【歐洲型】分支。

捷克官方說明,其首批確診病號來自意大利旅遊者,而意大利當局確診的首批病號是來自中國的中國旅客,地點是意大利的拉茲奧(Lazio)。意大利當局採集提供的相關新冠病毒基因數據如下(摘錄):

記錄編號:GenBank: QKE43667.1。
採集地點:Italy: Lazio。
採集時間:2020-02-28"
基因序列:601 gtntsnqvav lyq
Gvnctev pvaihadqlt ptwrvystgs nvfqtragcl igaehvnnsy 。
數據來源:美國衛生部冠狀病毒基因數據庫。#

其中位點614為G。這說明,北京新波疫情的新冠病毒病源來自中國大陸;該S-蛋白基因的【D614G】的變異或突變,發生在中國大陸;中國旅客把該病毒帶到了意大利。

那不是唯一的發生在中國本土的新冠病毒S-蛋白基因變異。譬如,武漢病毒所2019年12月30日採集的病號病毒基因序列WIV07、中疾控安徽中心2020年02月15日採集的病號病毒序列CHN/MAS525,兩者S-基因相似度就不是100%而是99%;時間間隔大約50天,S-基因就發生了變異,譬如T455A的變異(S-蛋白的基因位點455的T變異為A。注意,是S-蛋白的基因序列變異)。如下(摘錄):

S-基因比對(長度3819)相似度:3818/3819 (99%)。
Query 421 CTGGGCGTGTACTACCACAAGAACAACAAGAGC
TGGATGGAGAGCGAGTTCAGGGTGTAC
Sbjct 421 CTGGGCGTGTACTACCACAAGAACAACAAGAGC
AGGATGGAGAGCGAGTTCAGGGTGTAC
其中:Query:WIV07(武漢病毒所採集提供),Sbjct:CHN/MAS525(中疾控安徽CDC採集提供)。數據及方法:美國衛生部冠狀病毒基因數據庫,BLAST。#

可中國和國際學界並沒因此把新冠病毒劃分為【武漢型】和【安徽型】兩個類型分支。就【D614G】,同樣,國際官方和學界也沒因此變異而把新冠病毒做【歐洲型】的類別劃分(個人如何劃分是另一回事)。在美國衛生部病毒基因庫的關係樹那裡,即便是來自中國的或來自歐洲的病毒基因序列,分支也是按照整個基因序列的關係相似度排列的,不是僅僅根據一個蛋白或一個基因的變異而排列的。其實,國際學界多數人(包括中國學者)並不認為那個分類有啥意義(即該分類不成立):冠狀病毒的S-基因與動物受體ACE2彼此互動、過程中兩者都可能發生變異,但已發現的變異或突變並沒改變冠狀病毒S-基因的形態功能而使之可以做上述類型劃分。發生多個基因蛋白位點都是如此了,那麼,只發生一個位點變異就更是沒有那種類型劃分的意義。

簡言之,不管中疾控官員怎麼繞彎子搞甩鍋,事實證明北京本次新波疫情的病毒來自中國本土。


參考閱讀:

報道:捷克首批確診病號是來自意大利的旅客。
Czech health minister confirms first 3 coronavirus cases.
MARCH 1, 2020
https://medicalxpress.com/news/2020-03-czech-health-minister-coronavirus-cases.html

報道:意大利首批確診病號為來自中國的中國旅客。
Coronavirus, first two cases in Italy "Two Chinese people are on vacation in Rome" They arrived in Milan on 23 January.
https://www.corriere.it/cronache/20_gennaio_30/coronavirus-italia-corona-9d6dc436-4343-11ea-bdc8-faf1f56f19b7.shtml


調查論文:意大利首批確診病號為中國旅客一對夫婦,在意大利拉茲奧住院(基因樣本採集地)。
A doubt of multiple introduction of SARS-CoV-2 in Italy: A preliminary overview.
Journal of Medical Virology • March 2020
https://www.researchgate.net/publication/340032561_A_doubt_of_multiple_introduction_of_SARS-CoV-2_in_Italy_A_preliminary_overview 
The COVID-19 outbreak started officially in China in January 2020, although the virus was probably already circulating in the country since late October 2019 according to a recent report (Giovanetti et al. 2020). In Italy the first infected patient was officially detected on the night of February 20 in Codogno (Lombardia),
but a couple of Chinese tourists was hospitalized in Rome (Lazio) already at the end of January after the confirmation test of the infection. ..

美國當局防疫中心轉發意大利文章:新冠病毒S-基因蛋白D614G變異來自意大利拉茲奧病例。
SARS-CoV-2 Phylogenetic Analysis, Lazio Region, Italy, February–March 2020.
Barbara Bartolini, .... Author affiliations: National Institute for Infectious Diseases “Lazzaro Spallanzani” IRCCS, Rome, Italy.
Volume 26, Number 8—August 2020
https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/8/20-1525_article 
Abstract: We report phylogenetic and mutational analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 virus strains from the
Lazio region of Italy and provide information about the dynamics of virus spread. Data suggest effective containment of clade V strains, but subsequently, multiple waves of clade G strains were circulating widely in Europe.

不說國際學界,就中國自己的學者也認為中疾控和中科院的L/S類型分類不成立:
《新冠病毒已突變?專家:變化極小,不說明任何問題》。
2020-03-05 09:57:48新京報 記者:張勝坡 編輯:王婧禕。
http://www.bjnews.com.cn/feature/2020/03/05/699253.html 
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