元清兩朝作為由北方少數民族建立的大一統王朝，對中國歷史產生了深遠的影響。其中，最重要的一點惡果，從中華民文明的發展被阻斷的角度來看，可以歸結為對中華文明傳統發展路徑的中斷和扭曲。

元朝統治者在征服過程中帶來的戰亂和殺戮，對當時的社會經濟和文化造成了巨大的破壞。作為蒙古族建立的政權，元朝排斥漢族文化，這導致了中華文明發展受到了阻礙。例如，元朝對士人階層的打壓，對科舉制度的中斷，以及對漢族傳統文化的忽視，這些都對中華文化的連續性產生了負面影響。

比如消亡了很久的奴隸制重新出現，大量非蒙古、色目人遭到掠奪性的拐賣販賣，奴隸市場興盛無比；政紀廢弛至極，吏治腐敗至極；蒙古人色目人對漢族南人進行長期的奴役及壓榨及無道理的大量屠殺。例如元朝法典中有蒙古人殺漢人只須罰交燒埋銀及充軍；蒙古人打漢人漢人不許還手，只可叫人指證告官等。

元朝的統治者還從立國之初就採取了民族歧視、壓迫政策。把國人分為四等：一等蒙古人，二等色目人，三等漢人，四等南人。元朝政府將每二十家編為一“甲”，“甲主”由蒙古人擔任。這二十家就是甲主的奴隸，其衣服、飲食，甲主可隨意索取，女子、財產，也可隨心所用。在甲主控制下的漢人不能打獵、不能持有兵器、不得集會拜神、不得學習拳擊武術、不得趕集、趕場，甚至夜間走路也被禁止。

而元朝皇帝選妃的規定也是從古至今從所未有，在皇帝選妃之前，所有的女子一律不准婚嫁，也不得藏匿。

清朝的情況也類似，滿族統治者在初期對漢族文化同樣持有戒心，實施了一系列剃髮易服等政策，強化了滿漢之分，這不僅在政治上製造了民族矛盾，也在文化上造成了斷層。清朝初期的圈地、投充等政策嚴重破壞了中原地區的經濟基礎，影響了社會生產力的恢復和發展。

此外，清朝在思想文化上實行了愚民政策，如文字獄的盛行，極大限制了思想和學術的自由發展。目光短淺，閉關自守，只知道騎射冷兵器，將英國贈送的火炮扔在圓明園的角落長達60年無人問津。正是元清兩朝的統治，中斷了中華文明的發展路徑，導致了中華民族從元朝開始在文化、科技、經濟等方面逐漸落後西方。從而到了晚清被西方列強肆意踐踏，中華民族也走到了民不聊生，山河破碎的地步。