外蒙正式脫離中國是在1946年，那一年，國民政府正式承認外蒙是一個主權獨立的國家。而外蒙開始策劃獨立則要追溯到清朝末期。
密謀獨立
日俄戰爭以後，沙俄就將蒙古作為他的勢力範圍，與蒙古交往甚密，蒙古上層貴族開始產生親俄思想。宣統三年7月10日，以庫倫活佛為首的外蒙古僧俗封建主，在庫倫郊外召開四盟王公秘密會議，決議外蒙古“獨立”，並派人秘密出訪聖彼得堡請求俄國政府“庇護”。
面對送上門的領土，尼古拉二世自然是非常高興。辛亥革命後，清政府在全國的統治逐漸瓦解，蒙古貴族趁這個機會聯合沙俄解除了蒙古的清軍武裝，12月29日，博克多格根在庫倫登基，成為了所謂大蒙古國“神聖皇帝’”，史稱“博克多汗國”，後自稱“日光皇帝”。
蒙古叛軍聯合沙俄軍隊逐步掃蕩境內的清軍，大清烏里雅蘇台將軍連同700多清軍被俘，押送出境，蒙古獲得事實上的獨立。
中華民國成立後，不承認所謂“蒙古獨立”，由於國內一團混戰，北洋政府無力北顧，只能是不停和沙俄交涉，而沙俄也怕明目張胆吞併蒙古引起國際干涉，經過艱苦談判，中國以不在外蒙駐兵、殖民、設官，承認外蒙自治，承認《俄蒙協約》及其專條，換回俄國承認中國在外蒙的宗主權，基於宗主權而衍生出俄國承認外蒙古為中國領土一部分。
徐樹錚和外蒙古貴族合影
中國對蒙權力已由主權淪為宗主權。直到1915年，中、俄、蒙三方簽訂密約，蒙古撤銷獨立，改為在中國境內自治，大總統袁世凱冊封八世哲布尊丹巴為“呼圖克圖汗”。
1917年沙俄爆發十月革命，紅白雙方的鬥爭也蔓延到了蒙古，蒙古上層貴族害怕所謂“赤潮”，於是給北京發電，請求派兵保護。1919年6月，沙俄白軍謝苗諾夫率兵武力進犯外蒙古，導致外蒙古王公恐慌加劇，再次請求北洋政府派大軍進入外蒙古對其進行保護。
白俄哥薩克騎兵
北洋政府的考慮也很有意思，段祺瑞政府命令徐樹錚火速率軍前往外蒙，主持撤治之事，以奪陳毅之為己功，重振皖系的政治聲望。北洋將領徐樹錚率西北邊防軍第一師進入外蒙古。在11月17日，徐樹錚撤銷了外蒙自治，將外蒙古置於北洋政府的直接管轄之下。
此時沙俄內憂外患，根本無暇南顧，實在是解決蒙古問題的大好時機，事實上形勢也是一片大好。同年11月17日，外蒙古正式上書中華民國大總統徐世昌，呈請廢除俄蒙一切條約；南方孫中山護法軍政府亦致電慶賀。
11月22日，徐世昌“俯如所請，以順蒙情”，以《中華民國大總統公告》下令取消外蒙古自治，恢復舊制；同時取消《中俄聲明》和《恰克圖協定》，北京政府在庫倫設立“中華民國西北籌邊使公署”，由徐樹錚部（西北邊防軍）在庫倫、科布多等地駐防，並派兵收復唐努烏梁海。
庫倫戰敗
但這時，變數出現了，這個變數就是白俄男爵羅曼·馮·恩琴。到了1920年，由於中國國內仍然在軍閥混戰，收復外蒙的徐樹錚率兵回國， 在庫倫只留下了少量兵力，具體有多少呢？
身穿蒙古傳統服飾的羅曼·馮·恩琴
中外記載互相歧義，眾說紛紜，前蘇聯學者茲拉特金說在蒙古的中國軍隊有1.2萬人，卸任烏里雅蘇台專員的孟榘回憶說庫倫的中國駐軍有8000人，其中褚祺祥的步兵旅5000人，高在田的騎兵團1200人，而當時也在庫倫的李恆則說中國駐軍兵不過4000。根據後續的戰鬥記錄，李恆的說法較為可靠，中國在蒙古的駐軍不到兩個步兵旅。
1920年10月26日，已經在蒙古當地召集了千餘部眾的恩琴聯合蒙古哲布尊丹巴集團的叛軍共5000人向庫倫的中國守軍發動進攻。一幫烏合之眾，前兩次進攻都被打退，於是恩琴開始採取圍困戰術。他們盤踞在庫倫周邊燒殺搶掠，裹挾蒙古百姓參軍或傳遞情報，或偷襲中國軍隊。
到1921年1月下旬，庫倫已經三面被圍，很明顯，恩琴想讓中國軍隊主動棄城南逃，庫倫的中國孤軍堅守三個月來，已經彈盡糧絕，南邊的糧道早就被斷絕，北京的援助遙遙無期，凍死凍傷者甚多，士兵喪失鬥志，整個城市瀰漫着絕望。
中國軍隊在庫倫最後堅守的建築
1921年2月1日，恩琴指揮叛軍從東部發動猛烈進攻，並派1000餘人同時從南面發動進攻，一隊300人的叛軍攻破城門殲滅中國軍隊護衛哲布尊丹巴的兩個連，將之劫出城外。恩琴利用哲布尊丹巴號召蒙古人，叛軍士氣大增。
2月2日拂曉，叛軍再次對中國軍隊發動猛攻，褚祺祥部隊全線敗退，高在田率部逃跑，鎮撫使陳毅乘坐汽車逃跑，當地漢族商民隨之南逃。上午九點，恩琴匪軍占領庫倫，派兵繼續追擊中國軍隊。
恩琴進城後，對沒來得及逃跑的漢人進行大肆屠殺，同時遇害的還有蘇俄支持者。自此中國軍隊被迫從蒙古撤退，再也沒踏入這塊祖宗之地。
太上皇結局
不過恩琴畢竟是白俄，是蘇俄紅軍的死敵，因此蘇俄紅軍肯定不可能坐視他在外蒙古坐大，因此在恩琴的軍隊入侵外蒙古前後，蘇俄軍隊以及受到蘇俄支持的蒙古人民軍也開始在外蒙古境內與其作戰。
恩琴被處死前的留影
在當了不到半年的蒙古太上皇后，1921年7月6日，蘇蒙軍隊攻占庫倫，恩琴被迫出逃。8月20日，恩琴被蘇俄紅軍俘虜，9月15日，恩琴被判處死刑並被處死。
