明軍全線潰敗，李定國下令放棄貴州時候，就已經估計到清軍必然乘勝向雲南推進，明軍不可能保住昆明。十二月初九日他派使者向永曆帝報告清軍勢大難敵，奏請“上當移蹕以避清人之鋒”。永曆朝廷自建立之始，一直如一葉扁舟隨風漂泊。移駐到安龍時候雖然比較穩定，但實際上是處於孫可望挾制之下，苟且偷生。直到1656年（永曆十年）移居昆明以後才過上比較安定的日子，朝廷各衙門開始恢復正常工作秩序。雲南百姓從大西軍平定全省後，短暫期間生活穩定安樂，然而，好景不常，前方兵敗的消息傳來，立即在朝野上下引起巨大震動。

李定國建議移蹕，在朝諸臣對於放棄昆明以後朝廷移往何處有不同意見，一部分人主張遷往四川，另一部分人主張向西逃竄。李定國開始同意移蹕四川方案，後改變主意，決定轉向滇西。撤出昆明後，一些將領分道揚鑣，馮雙禮，陳建，王會，艾承業（艾能奇之子）率部向四川建昌轉移。這種分離反映了晉王李定國和蜀王劉文秀舊部之間的不合。劉文秀在孫可望降清後，安撫了孫可望的舊部，改編成自己的隊伍。李定國推行歧視政策，把兵將分為“晉兵”，“秦兵”，劉文秀被看成是“秦兵”的代表人物，不受信任，失勢抑鬱而死，他的部將們對李定國深為不滿。當這些文官武將看到李定國和朝廷改變主意，由入川改為西撤，他們感到前途渺茫，先後脫離了朝廷。

順治十六年正月初三日，清軍未遇抵抗就占領了昆明。初四日，永曆帝到達永昌，跟隨的官員已經為數不多。文臣劉茝起草文書批評李定國，反映了兵敗前後永曆朝廷內以原蜀王劉文秀為代表的一部分文臣武將對李定國用人行政的不滿。李定國引咎自責，奏請奉還黃鉞，削去官職，戴罪視事。永曆帝給以降三級的名義處分。

永曆君臣退至永昌時，留鞏昌王白文選守玉龍關。清吳三桂，趙布泰遣前鋒統領白爾赫圖進剿。白文選拔營逃遁。永曆朝廷得知白文選兵敗，撤離永昌。李定國命令部將靳統武領兵護駕，倉促西撤。此時又有相當一批官員落荒而逃。

明慶陽王馮雙禮等人在永曆朝廷放棄昆明時，率部入四川建昌地區，本是打算避開清軍主力，轉入敵後，會同夔東十三家的軍隊另創局面。由於李定國帶領主力西撤，這兩支明朝軍隊被清朝入滇軍隊隔斷，相距越來越遠。馮雙禮部雖然順利到達建昌地區，但勢單力孤，難以有所作為。之後不久，馮雙禮部將狄三品叛變降清，把馮雙禮擒獲交給了清軍。（待續）