昨天發了一帖，說可以用鑑定酶切位點來檢查一個基因組是否人造。這個方法其實是根據老夫過去構建construct的經驗，根據的是一般的基因克隆途徑。簡單說就是天然基因組的酶切位點一般是隨機分布，而人工的往往不是。做基因工程的載體，一般經過改造，在一些特殊位點，比如一些調控因子附近會使用很多新的常用位點，天然的基因組出現這種情況概率很小。你插入的基因兩側附近也會留下一些常用酶切位點，在天然基因組也很少見。老夫當然沒有去鑑定過那個基因組是否天然基因組（沒這個必要）， 但時常通過別人克隆的載體圖查出他們的克隆途徑，那個基因先插入，那個基因後插入，基因是先插入後突變還是先突變後插入，有時甚至能看出對方的克隆習慣，喜歡用什麼酶，喜歡平端連接還是粘端連接等等，這也是學習的一部分（像讀圍棋譜，能感覺有些手法很巧妙，有些則很笨）。記得有一次老闆交給一張天然植物基因圖譜， 實是半天然，別人克隆了大片段，我們要切下其中一小段。當時PCR技術沒有現在這麼方便，看完腦袋就一暈，找不到下手的地方呀。當然這個辦法也只是提供了一種可能性，精確認定還需要其他分析。就像檢查槍擊案， 你可以根據現場殘留的子彈推出大致是那種槍發射的，然後通過找槍再去驗證誰是兇手。而要在法庭上給罪犯定罪，往往還需要提供其他的法醫學證據。
現在基因克隆出現了很多老夫不懂的新技術。你當然可以用這些技術來掩蓋克隆基因組的酶切分布。但和犯罪一樣，你掩蓋了這個手法還會在另一個手法出問題。還是以案件偵破為例，兇手殺了人，可以澆一桶汽油把屍體燒掉，但汽油會留下痕跡。如果這個兇手特牛，為了掩蓋汽油痕跡，又用水龍頭沖洗現場，那麼沖水的原因，現場是否沖洗乾淨，水龍頭的來歷，沖水造成的大動靜有沒有被鄰居看見等等又可以被警察當成線索追查。基因組改造也一樣，你可以用各種手段改變原有基因組，但使用什麼手段就可能留下那個手段使用後的痕跡。老祖宗早就說了，要想人不知，除非己莫為。有些道理是永恆不變的。