去年12月底发生在武汉的肺炎病毒在短短的一个月内， 迅速播散全国乃至全球，武汉更是重中之重，怀疑似病例数确诊病例数和死亡人数在近日增加很快。 武汉从前日开始封城，全国很多城市跟进。各种谣传尘嚣直上，阴谋论者死灰复燃。 专家没有权威的解读， 人们在焦虑中度过一天又一天。 就连我这个游子，也熬过不眠之夜，担心在武汉的亲朋好友安危。 春节期间， 适逢周末， 想用自己的生物医学知识，写一篇科普，可惜自己又不是病毒专业，知识面有限。但做总比不做好。 不得不说，中国科学家在武汉肺炎病毒快速反应上，是非常严谨的，短短二十多天（一月十七日和一月二十三日），就完成了病毒高通全长测序，并命名为武汉海鲜市场肺炎病毒 （Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1 ）， 基因登记号为 MN908947 和NC_045512， 两个团队所测序的结果完全一致。由于序列的公布， 为以后的RT-PCR精准检测提供了基础。
运用上述基因序列，德国， 日本和香港立即公布的PCR检测方案： 1.香港方案： https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/peiris-protocol-16-1-20.pdf?sfvrsn=af1aac73_4 2.德国方案（也叫WHO方案）：https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2 3.日本方案： https://www.niid.go.jp/niid/images/pathol/pdf/Detection_of_nCoV_report200121.pdf
下面抽一点时间描述这三个方案
日本方案： 上游引物：TTGGCAAAATTCAAGACTCACTTT 下游引物： CACAAAGGAATTTTTATGAACCACA 片段长度： 547bp CTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGATGTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTCTTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGACTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATGATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACACACTGGTTTGTAA
香港方案： 上游引物：TAATCAGACAAGGAACTGATTA 探针： CCGCAAATTGCACAATTTGC 下游引物： CATGGAAGTCACACCTTCG 片段长度： 110bp. TAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAGCGTTCTTCGGAATGTCGCGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCG
德国方案（WHO方案）： 上游引物:GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG 探针: CAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC 下游引物:TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG 片段长度： 100bp GTGAAATGGTCATGTGTGGCGGTTCACTATATGTTAAACCAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGCCACAACTGCTTATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG
如果能够迅速地一步法PCR， 减少样品提取的过程， 就极大限度地可以减少医务人员的工作量，和减少交叉感染的机会。
众所周知， 戴口罩是防止被传染的主要方法。WHO提出3M N95 1860或1870， 是最可靠的口罩。 3M的N100 可靠的阻断这个冠状病毒的口罩， 可惜非常贵。 由于国内的一些大医院院长们的开明，国际上的爱国华侨纷纷自费购买上述口罩， 捐献给一线的医护人员。我的一位朋友就一口气买了2000个，捐献给了武汉。现在美国这两型号的口罩全线缺货。
在阻止病毒复制上，由于这个冠状病毒属于RNA病毒，目前成功用于抗RNA病毒复制的药物，主要是抗HIV的药物， 如Lopinavir and Ritonavir，初步的结果认为， 这两药物对于控制武汉冠状病毒引起的病变，有一定的疗效。 可惜这些药物很贵， 有一定的肝损伤。 在病毒的作用机理上， 研究者们比较集中在Ace2蛋白上。冠状病毒的Spike蛋白通过Ace2, 黏附到被感染的细胞 （请搜索www.mdpi.com，viruses-12-00135.pdf） 。Aces作为武汉冠状病毒的受体，进入细胞内复制。可以肯定，如果能够尽快设计出药物， 靶定这个受体， 有可能控制病毒扩散。 其他重要的蛋白有3C, RaTGI3(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1.full.pdf), 本人了解不多， 所以不在这里赘述。
武汉海鲜市场肺炎病毒的宿主可能是蝙蝠，中间宿主可能是蛇或其他动物。昨天有传， 说武汉肺炎和SARS病毒有80%同源性，是谣传。对此， 我比较了NC_045512和美国病毒库的冠状病毒序列， 其中2018年由南京军事医学研究所的Hu D, Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45 (基因登记号MG772933.1)同源性达到87.99%， 有兴趣的朋友可以自己去进行比较。 同源性在80%以上的SARS样冠状病毒有接近100个， 这里不再赘述。
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