六月中旬，在新發病例清零50多天后的首都北京，再次發現新發病例。最先發生在新發地農貿市場，並且在海鮮市場的三文魚案板上查出新冠病毒。到今天北京新發病例增加至159例。國家疾控中心的科學家在第一時間採集了樣品，進行了全長基因測序。經過拼接後，其中三株高質量序列於今日凌晨上傳到全球最大的冠狀病毒數據庫。

分析這三柱 SARS-CoV-2 序列，不難發現，該病毒株是參與歐洲，紐約州廣泛傳播的病毒。這個病毒株占全世界病例數的60%以上 （我會在文章接受後做一個介紹）。 病毒帶有T14407C 和A23403G 兩個主要突變，和241，3037兩個次要突變。這個病毒株在傳播過程中，有一些病毒獲得了28881-28883三個鹼基突變。追蹤這些突變的類型， 非常容易發現病毒地傳播路徑。

在今天凌晨看到這些序列後，我把它們先和武漢一株比較， 找出其突變類型， 再根據突變類型和病毒數據庫地48031個全長基因組進行了比對，發現三株病毒都含有241/3037/6026/14407/23403突變和28881-28883三個鹼基突變 （見圖）。比對所有地序列後，發現符合這些突變地已經上傳地病毒株只有來自哥倫比亞的圖馬科 （Tumaco）的一位27歲的男性病人分離出的病毒匹配北京新發病毒株，該病毒株帶有特定的靶標， 即 C6026T 突變，該基因登記號為EPI_ISL_456154。