六月中旬，在新发病例清零50多天后的首都北京，再次发现新发病例。最先发生在新发地农贸市场，并且在海鲜市场的三文鱼案板上查出新冠病毒。到今天北京新发病例增加至159例。国家疾控中心的科学家在第一时间采集了样品，进行了全长基因测序。经过拼接后，其中三株高质量序列于今日凌晨上传到全球最大的冠状病毒数据库。

分析这三柱 SARS-CoV-2 序列，不难发现，该病毒株是参与欧洲，纽约州广泛传播的病毒。这个病毒株占全世界病例数的60%以上 （我会在文章接受后做一个介绍）。 病毒带有T14407C 和A23403G 两个主要突变，和241，3037两个次要突变。这个病毒株在传播过程中，有一些病毒获得了28881-28883三个碱基突变。追踪这些突变的类型， 非常容易发现病毒地传播路径。

在今天凌晨看到这些序列后，我把它们先和武汉一株比较， 找出其突变类型， 再根据突变类型和病毒数据库地48031个全长基因组进行了比对，发现三株病毒都含有241/3037/6026/14407/23403突变和28881-28883三个碱基突变 （见图）。比对所有地序列后，发现符合这些突变地已经上传地病毒株只有来自哥伦比亚的图马科 （Tumaco）的一位27岁的男性病人分离出的病毒匹配北京新发病毒株，该病毒株带有特定的靶标， 即 C6026T 突变，该基因登记号为EPI_ISL_456154。