設萬維讀者為首頁 萬維讀者網 -- 全球華人的精神家園 廣告服務 聯繫我們 關於萬維
 
首  頁 新  聞 視  頻 博  客 論  壇 分類廣告 購  物
搜索>> 發表日誌 控制面板 個人相冊 給我留言
幫助 退出
兩由之的博客  
花開花謝兩由之-----魯迅  
https://blog.creaders.net/u/7277/ > 複製 > 收藏本頁
網絡日誌正文
你所不知道的引起武漢新型冠狀病毒肺炎的病毒 2020-01-31 08:33:16

截至今天一月三十一日早上,美國國立衛生研究院病毒數據庫有六株武漢新型肺炎冠狀病毒全長測序,大陸兩個,香港兩個,美國CDC兩個,序列與中國測序結果全部一致。也就是說,目前在中國傳播並擴散到諸多國家,來源是同一病毒。


檢索美國NIH病毒數據庫,一共有56株薩斯病毒,全部由華人測得,與武漢新型肺炎冠狀病毒同源性高,全部都在80%以上。可以認為,它就是SARS的變種。

 

138株蝙蝠冠狀病毒,分布於全世界二十多個國家,與武漢新型肺炎冠狀病毒同源性非常高。最高一株為南京軍事醫學科研所,同源性達89.12%,還有一株也來自南京軍事醫學研究所,同源性為88.65%。基本可以認為,蝙蝠冠狀病毒的變異,生成了武漢新型肺炎冠狀病毒。

 

573株中東冠狀病毒,分布在世界各地。與武漢肺炎病毒同源性低,在70%左右。基本可以排除這個病毒引起武漢新型冠狀病毒肺炎的可能性。 


879株豬冠狀病毒,分布世界各地。與武漢肺炎病毒同源性低,在60-65%左右。


以下就以MN908947.3以為例,進行全基因組比較,找出它的同源性,Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, (2020-01-23)GenBank: MN908947.3


第一部分: 與SARS冠狀病毒比較


SARS coronavirus GD01,(軍事醫學科學院,2003)

GenBank: AY278489.2

Percentage of Identity: 82.24%


SARS coronavirus BJ02, (軍事醫學科學院,2003)

GenBank: AY278487.3

Percentage of Identity: 82.25%


SARS coronavirus BJ01, (軍事醫學科學院,2003)    

GenBank: AY278488.2

Percentage of Identity: 82.01%


第二部分: 蝙蝠SARS冠狀病毒比較


Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZXC21, (南京軍事醫學研究所,2018)

GenBank: MG772934.1

Percentage of Identity: 88.65%


Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45, (南京軍事醫學研究所 2018 )

GenBank: MG772933.1

Percentage of Identity: 89.12%


Bat coronavirus BtCoV/Rh/YN2012 isolate BtCoV/Rh/YN2012_Rs4259 (武漢病毒所 2019)

GenBank: MG916903.1

Percentage of Identity: 63.69%


Bat SARS CoV Rs672/2006, (武漢病毒所)2010

GenBank: FJ588686.1

Percentage of Identity: 83.25%


Bat coronavirus Vs-CoV-1 genomic RNA, nearly complete genome (日本,2019)

GenBank: LC469308.1

Percentage of Identity: 72.91%


Bat coronavirus strain BtCoV92, complete genome (新加坡2019)

GenBank: MK492263.1

Percentage of Identity: 71.37%


Bat coronavirus CDPHE15/USA/2006, complete genome(NIAID, 2018)

NCBI Reference Sequence: NC_022103.1

Percentage of Identity: 80.91%


Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome (德國,2018)

NCBI Reference Sequence: NC_014470.1

Percentage of Identity: 80.44%


Zaria bat coronavirus strain ZBCoV, partial genome (尼日利亞,2016)

GenBank: HQ166910.1

Percentage of Identity: 71.12%


Bat coronavirus CDPHE15/USA/2006, complete genome (美國NIAID)

GenBank: KF430219.1

Percentage of Identity: 80.91%


Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome (德國,2010)

GenBank: GU190215.1

Percentage of Identity: 80.44%


第三部分:與中東冠狀病毒比較 (mers CoV)


Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate MERS-CoV camel/Kenya/C1272/2018, complete genome (肯尼亞,2019)

GenBank: MH734115.1

Percentage of Identity: 71.31%


Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate MERS-CoV camel/Nigeria/NV1673/2016, complete genome (尼日利亞,2016)

GenBank: MG923478.1

Percentage of Identity: 71.15%


Middle East respiratory syndrome coronavirus strain ChinaGD01, complete genome (中國 2016)

GenBank: KT006149.2

Percentage of Identity: 71.15%


Middle East respiratory syndrome coronavirus isolate Qatar4, complete genome(英國,2014)

GenBank: KF961222.1

Percentage of Identity: 71.15%


Middle East respiratory syndrome coronavirus isolate KSA-CAMEL-378, complete genome(沙特,2014)

GenBank: KJ713296.1

Percentage of Identity: 71.07%


第四部分:全部蝙蝠冠狀病毒基因登記號


1. Bat SARS coronavirus Rf1,     

29,709 bp Accession: DQ412042.1 GI: 89514809

 

2. Bat SARS coronavirus Rm1,     

29,749 bp Accession: DQ412043.1 GI: 89514824

 

3.Bat SARS CoV Rs672/2006,     

29,059 bp Accession: FJ588686.1 GI: 255733149

 

4.Bat SARS coronavirus Rp3,    

29,736 bp Accession: DQ071615.1 GI: 72256267

 

5.Bat SARS coronavirus HKU3-1,     

29,728 bp Accession: DQ022305.2 GI: 76160337

 

6.bat SARS coronavirus HKU3-3,     

29,711 bp Accession: DQ084200.1 GI: 71796716


7.bat SARS coronavirus HKU3-2,     

29,687 bp  Accession: DQ084199.1 GI: 71796704

 

8. Bat SARS coronavirus HKU3-13,     

29,677 bp Accession: GQ153548.1 GI: 292660245

 

9.Bat SARS coronavirus HKU3-12,     

29,704 bp Accession: GQ153547.1 GI: 292660233

 

10.Bat SARS coronavirus HKU3-11,     

29,695 bp Accession: GQ153546.1 GI: 292660221

 

11.Bat SARS coronavirus HKU3-10,     

29,695 bp Accession: GQ153545.1 GI: 292660209

 

12.Bat SARS coronavirus HKU3-9,     

29,695 bp Accession: GQ153544.1 GI: 292660197

 

13.Bat SARS coronavirus HKU3-8,     

29,681 bp Accession: GQ153543.1 GI: 292660183

 

14.Bat SARS coronavirus HKU3-7,     

29,716 bp Accession: GQ153542.1 GI: 292660171

 

15.Bat SARS coronavirus HKU3-6,     

29,704 bp Accession: GQ153541.1 GI: 292660159

 

16.Bat SARS coronavirus HKU3-5,     

29,704 bp Accession: GQ153540.1 GI: 292660147

 

17.Bat SARS coronavirus HKU3-4,     

29,704 bp  Accession: GQ153539.1 GI: 292660135

 

18.Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZXC21,     

29,732 bp Accession: MG772934.1 GI: 1369125429


19.Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45,     

29,802 bp Accession: MG772933.1 GI: 1369125417


20.Bat SARS-like coronavirus Rs3367,     

29,792 bp Accession: KC881006.1 GI: 556015127

 

21.Bat SARS-like coronavirus RsSHC014,     

29,787 bp  Accession: KC881005.1 GI: 556015114

 

22.Bat SARS-like coronavirus WIV1,     

30,309 bp  Accession: KF367457.1 GI: 556015142

 

23. Bat SARS-like coronavirus isolate Rs9401,     

29,769 bp Accession: KY417152.1 GI: 1270541521

 

24.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs7327,     

30,307 bp Accession: KY417151.1 GI: 1270541507

 

25.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4874,     

30,311 bp  Accession: KY417150.1 GI: 1270541493

 

26.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4255,     

29,743 bp  Accession: KY417149.1 GI: 1270541480

 

27.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4247,     

29,743 bp Accession: KY417148.1 GI: 1270541467

 

28.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4237,     

29,741 bp Accession: KY417147.1 GI: 1270541454

 

29.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231,     

29,782 bp Accession: KY417146.1 GI: 1270541441

 

30.Bat SARS-like coronavirus isolate Rf4092,     

29,710 bp Accession: KY417145.1 GI: 1270541428


31.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4084,     

29,770 bp Accession: KY417144.1 GI: 1270541414

 

32.Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4081,     

29,741 bp Accession: KY417143.1 GI: 1270541401

 

33.Bat SARS-like coronavirus isolate As6526,     

29,725 bp Accession: KY417142.1 GI: 1270541388

 

34.Bat coronavirus Cp/Yunnan2011,     

29,452 bp Accession: JX993988.1 GI: 442796484

 

35.Bat coronavirus Rp/Shaanxi2011,     

29,484 bp Accession: JX993987.1 GI: 442796476

 

36.Bat SARS-like coronavirus YNLF_34C,     

29,723 bp Accession: KP886809.1 GI: 916354756


37.Bat SARS-like coronavirus YNLF_31C,     

29,723 bp Accession: KP886808.1 GI: 916354744


38.Bat coronavirus (BtCoV/279/2005),     

29,741 bp Accession: DQ648857.1 GI: 109893933

 

39.Bat coronavirus (BtCoV/273/2005),     

29,704 bp Accession: DQ648856.1 GI: 109893923

 

40.SARS-related bat coronavirus isolate Longquan-140 orf1ab polyprotein, spike glycoprotein, envelope protein, membrane protein, and nucleocapsid protein genes, complete cds

29,676 bp Accession: KF294457.1 GI: 656462529


41.SARS-related bat coronavirus isolate Anlong-111 orf1ab polyprotein and orf1a polyprotein genes, complete cds

21,479 bp Accession: KF294455.1 GI: 656462524


42.SARS-related bat coronavirus isolate Jiyuan-331 orf1ab polyprotein gene, complete cds

21,444 bp Accession: KF294456.1 GI: 656462527


43.BtRf-BetaCoV/JL2012,     

29,037 bp Accession: KJ473811.1 GI: 641457765

 

44.Bat coronavirus BtCoV/Rh/YN2012 isolate BtCoV/Rh/YN2012_Rs4259,     

29,076 bp Accession: MG916903.1 GI: 1597473558


45.Bat coronavirus BtCoV/Rh/YN2012 isolate BtCoV/Rh/YN2012_Rs4125,     

29,074 bp Accession: MG916902.1 GI: 1597473545


46.Bat coronavirus BtCoV/Rh/YN2012 isolate BtCoV/Rh/YN2012_Rs3376,     

29,102 bp Accession: MG916901.1 GI: 1597473532


47. Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008,     

29,276 bp Accession: NC_014470.1 GI: 304633675


48. BtRs-BetaCoV/HuB2013,     

29,658 bp Accession: KJ473814.1 GI: 641457801

 

49. BtRf-BetaCoV/SX2013,     

29,461 bp Accession: KJ473813.1 GI: 641457790

 

50.BtRf-BetaCoV/HeB2013,     

29,443 bp Accession: KJ473812.1 GI: 641457779

 

51. UNVERIFIED: SARS-related coronavirus isolate F46,     

29,722 bp Accession: KU973692.1 GI: 1189483555


52. BtRs-BetaCoV/YN2013,     

29,142 bp Accession: KJ473816.1 GI: 641457823

 

53. BtRs-BetaCoV/GX2013,     

29,161 bp Accession: KJ473815.1 GI: 641457812

 

54.Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008,     

29,276 bp Accession: GU190215.1 GI: 301298998


55.Bat coronavirus strain 16BO133,     

29,075 bp Accession: KY938558.1 GI: 1220516375

  

56.SARS-like coronavirus WIV16,     

30,290 bp Accession: KT444582.1 GI: 940378824


瀏覽(1312) (2) 評論(0)
發表評論
我的名片
兩由之
註冊日期: 2013-02-16
訪問總量: 681,206 次
點擊查看我的個人資料
Calendar
最新發布
· 【我的自畫像】
· 【七律】 自題兩首 (外一首)
· 童年的記憶:我心中粟自成老師
· 雪葵歸隱 (附七律一首)
· 【布翛停共和國記事】
· 【新全能神】
· 米爾斯海默評俄烏危機:你拿木棍
友好鏈接
· 紫荊棘鳥:-*-紫色王家思絮絮-*-
· 七郎:七郎博客
· 老冬兒:老冬兒的博客
· 七分兒:七分兒
分類目錄
【雜文】
· 【我的自畫像】
· 【布翛停共和國記事】
· 【新全能神】
· 【華為手機終於變成板磚了】
· 大疆的人設是如何在我心目中崩塌
· 【也談封殺微信】
· 【雜文】 牛奶法
· 【快訊】 美國好大夫集團CEO李珍
· 【散文】 罵架
· 【一個不愛讀書的民族是沒有希望
【攝影詩】
· 【五排】 狼血月
· 【五律】 題鶴
· 再談攝影和寫詩
· [七律] 聽雨
· 【木蘭花慢】 流水幽情
· 【七律】 賦鸕鶿
· 【七律】 賦白鷺
· 【攝影詩】 七律: 曉鷺
· [詩畫] 五律:賦雪雁
· [詩配畫] 九張機: 九鷺圖
【從醫手記】
· 【漫談新冠疫苗的選擇和接種輝瑞
· 【快報】: 北京輸入性新型冠狀
· COVID-19 病毒朔源的十個疑問
· 你所不知道的引起武漢新型冠狀病
· 武漢海鮮市場肺炎病毒一席談
· 也談劉曉波先生的肝癌 (純粹醫
· 【健康小貼士】大屏幕顯示屏使用
· 【醫學綜述】 請別相信維生素B17
· 從醫手記之二: 初生牛犢不怕虎
· 從醫手記-之一: 小醫生也能治大
【音樂隨筆】
· [音樂隨筆] 提姆·懷特的《午夜天
【詩歌-詞】
· 【少年游】 相思
· 【沁園春】 自壽
· 【沁園春】 有感於颶風 Irma
· 【沁園春】 詠梅
· 【賀新郎】 偶感
· 【蝶戀花】 也罷
· 【三台】 詞組 (十灰韻部)
· 【滿庭芳】 友梅
· 《浣溪沙》雪夜念慈
· 【水調歌頭】 寫於台灣大選結果
【詩歌-格律詩】
· 【七律】 自題兩首 (外一首)
· 雪葵歸隱 (附七律一首)
· 【五律】 再賦白頭鷹
· 【七律】 自題
· 【七律】 近事隨感
· 【七律】 驟雨 (借黃庭堅句‘江
· 【七絕】 雜趣 (十三元, 兩首
· 【七律】 近事隨感
· 【七律】 近事隨感
· 【七絕】 雜感兩首
【詩歌-現代詩歌】
· 【新詩】 夢
· 2018
· 掐死他們, 狗日的詩人
· 【新詩】 念想
· 孤獨的詩人 (雜詩)
· 【新詩】 說是.....
· 【新詩】 緣
· [新詩兩首] 《霧中隨想》和《葦
· [新詩] 寫給初冬的歌
· [新詩] 題凡高的畫作《皮鞋》
【攝影-人相和掃街】
【攝影-自然景觀】
· [攝影] 華盛頓DC, 到此一游
· [攝影] 秋水流情
· 意識流 (另類攝影)
· [攝影] 感悟生命 (2)
· [攝影] 感悟生命
· [攝影] 好厲害的太陽
· [攝影] 好大一棵樹...
· [攝影] 登高望遠
· [攝影] 禪茶一味
· [攝影] 滴水之恩
【攝影-飛鳥雨蟲】
· [攝影] American Coot!
· 攝---影
· 屌絲眼中的白富美
· [攝影詩] 寫給伊人的歌
【攝影-花草】
· 荷花: 我這一輩子
· 花說: 秋天快來了,趕快開,不
· [感悟生命] 為了自由,陽光和空
· [詩和影] 空谷幽蘭
· [攝影] 蘭幽氣自華
· [攝影]石榴裙
· [攝影] 空谷幽蘭
· [攝影] 舞
【詩禪】
· [詩禪] 五絕: 悟入 (學臨濟宗
· [詩禪] 七絕: 有蟬無蟬
· [詩禪] 五律: 月夜看潮 (臨濟
· [詩禪] 禪茶一味
· [禪詩] 青山禪
· 布袋和尚的禪詩《插秧偈》賞識
· 王維禪詩欣賞
· [詩禪] 五絕: 偈語
· [五絕] 禪詩兩首
【感時】
· 【我為什麼喜歡華為產品】
· 【輓歌】
· 【七律】 讀韋思浩事跡有感
· 姚貝娜捐獻角膜和我的博士同學姚
· 憶父文
· 每條城管掩殺的大街---來自李承
· [雜文] 復活的差不多先生
· [江城子] 難兄難弟 (薄王對簿公
· [攝影詩] 歷史
· 【七絕】 熱烈祝賀劉總成為第一
【攝影】
· 大疆---悟
· 【攝影】 一隻土撥鼠的自言自語
· [攝影] 夕陽下人與大雁的和諧
· [攝影] Shenandoah的秋色
· [攝影] 飄柔
· [攝影] 聖誕老人的雨傘 (創意攝
· [攝影] 動如脫兔
· [攝影] 科學精神
· [攝影] 青青河邊草
· [攝影] 這年頭, 老公不好當呀
【詩論】
· 米爾斯海默評俄烏危機:你拿木棍
· 【閒話-詩話-趣話】 走狗
· 【詞話】 李清照《多麗》 詠白菊
· [詩話] 金秋賞菊
· 【談虎】 之一: 虎詩虎詞
· [詩話] 秋天裡的春天
· 白居易論詩歌創作----凌 彰 [ZT]
· [詩論] “作詩”與“玩詩”
· 談攝影和寫詩
· 【李商隱無題詩20首全集】
【政論】
· 特朗普化的華人們
· 我們都有“間諜”的潛質
· 貿易戰中的一個重點: 出口退稅
· 2018年有關中國的十件大事
· 【郭文貴究竟是誰的代言人】
· 【ZT】祁同偉接連殺人?拜託!人
· 【深度分析】 中國最危險的一代
· 【談虎】之二: 奇談怪論---虎患
· 【歷史回眸】 二戰期間駝峰航線
· 鄧小平所不能容忍的土地村民集體
【千歲悠】
· 童年的記憶:我心中粟自成老師
· 【閒人賦】
· 我父親的人格魅力----寫於父親節
· 青海方言集萃
· 閒言碎語話中秋
· 中國魚幣考
· 我的乾媽
· 原來.......
· [ZT] 有個mRNA,覺得自己很孤單.
· 雜談一籮筐
存檔目錄
2025-09-04 - 2025-09-04
2025-04-15 - 2025-04-15
2023-04-20 - 2023-04-20
2022-11-20 - 2022-11-20
2022-10-28 - 2022-10-28
2022-08-16 - 2022-08-16
2022-03-12 - 2022-03-12
2021-02-04 - 2021-02-10
2020-09-22 - 2020-09-22
2020-08-13 - 2020-08-13
2020-06-18 - 2020-06-18
2020-04-18 - 2020-04-18
2020-01-27 - 2020-01-31
2019-10-08 - 2019-10-08
2019-04-02 - 2019-04-04
2019-03-09 - 2019-03-09
2019-01-22 - 2019-01-22
2018-12-09 - 2018-12-21
2018-11-07 - 2018-11-15
2018-07-23 - 2018-07-23
2018-05-09 - 2018-05-16
2018-04-15 - 2018-04-19
2018-02-28 - 2018-02-28
2018-01-16 - 2018-01-16
2017-12-31 - 2017-12-31
2017-11-17 - 2017-11-28
2017-10-25 - 2017-10-25
2017-09-10 - 2017-09-10
2017-07-13 - 2017-07-13
2017-06-18 - 2017-06-30
2017-05-14 - 2017-05-25
2017-04-20 - 2017-04-23
2017-03-12 - 2017-03-28
2017-02-05 - 2017-02-23
2017-01-23 - 2017-01-30
2016-12-11 - 2016-12-31
2016-09-15 - 2016-09-15
2016-05-28 - 2016-05-28
2016-03-01 - 2016-03-24
2016-02-02 - 2016-02-18
2016-01-10 - 2016-01-27
2015-12-03 - 2015-12-03
2015-11-11 - 2015-11-19
2015-10-10 - 2015-10-30
2015-09-03 - 2015-09-03
2015-08-18 - 2015-08-28
2015-07-13 - 2015-07-13
2015-05-03 - 2015-05-03
2015-04-22 - 2015-04-22
2015-02-12 - 2015-02-21
2015-01-14 - 2015-01-17
2014-12-04 - 2014-12-14
2014-11-25 - 2014-11-30
2014-10-01 - 2014-10-27
2014-09-01 - 2014-09-24
2014-08-09 - 2014-08-31
2014-07-10 - 2014-07-10
2014-06-03 - 2014-06-21
2014-05-02 - 2014-05-27
2014-04-27 - 2014-04-30
2014-03-17 - 2014-03-17
2014-02-28 - 2014-02-28
2013-12-03 - 2013-12-14
2013-11-01 - 2013-11-30
2013-10-01 - 2013-10-30
2013-09-04 - 2013-09-29
2013-08-01 - 2013-08-31
2013-07-01 - 2013-07-30
2013-06-02 - 2013-06-30
2013-05-02 - 2013-05-31
2013-04-01 - 2013-04-29
2013-03-01 - 2013-03-31
2013-02-16 - 2013-02-28
 
關於本站 | 廣告服務 | 聯繫我們 | 招聘信息 | 網站導航 | 隱私保護
Copyright (C) 1998-2026. Creaders.NET. All Rights Reserved.