過去一兩百年裡科學與宗教的關係是很多人關心的問題，也是很多爭論的中心議題。其實，在科學與宗教之間還存在着一個過渡帶，那就是超自然。過去的一兩百年裡人們之所以跨越了這個過渡帶而直接使科學與宗教進行了交鋒，是因為在以西方世界為主的大多數具有宗教信仰的國度里，宗教界是超自然力量的主要代言人，而科學又是在基督教的世界裡脫穎而出的。因此，一旦涉及到超自然的問題，人們很容易就在宗教和科學這兩個陣營中進行站隊，而站隊的結果便是雙方跨過不具宗教背景的超自然的意義來直接進行交鋒。這裡的一個重要原因是宗教都具有排它性，因此任何一個宗教都不主張離開了自己的教義去談超自然，而傳統的科學又具有強烈的反超自然的傾向，所以當科學與宗教發生交鋒時，不具宗教色彩的超自然這個過渡帶也就自然而然地被跨了過去。

其實，科學與宗教跨過超自然而直接進行交鋒是導致雙方在辯論中很難說服對方的一個原因。我們知道宗教是高於一般的超自然現象的。是否存在超自然本身是一個零一答案的問題，而宗教本身則具有對於超自然的力量是如何作用在這個世界上並如何要求我們有相應的反應的一整套複雜的內容。由於至今為止對於很多宗教教義存在着解釋上的不明確性和不一致性，使得人們在進行爭論的時候往往是着眼於對教義的具體解釋上（比如有關上帝造亞當的教義與生物進化之間的表面不一致性等），站在科學陣營里的人強調現有的宗教解釋不符合科學的發現，而站在宗教陣營里的人則由於缺少必要的神學理論上的突破（我本人相信上帝一直在期待着基督徒們在神學理論上取得突破）而堅持已有的教義而不肯讓步，所以雙方相持不下。在這過程中，雙方都忽略了一點，那就是科學的反宗教的根基其實並不是在於對具體的宗教教義的否定，而是在於對超自然存在的否定，一旦人們能夠有力地表明超自然的存在，科學的反宗教的根基就被徹底動搖，科學的反宗教的防線也因而被徹底衝垮，那個時候人們再來討論具體的宗教和對具體的教義的解釋的時候就是一個神學理論的問題，而不是宗教與科學的衝突的問題了。

1986年我在中國科技大學讀研究生的時候，曾經是了中國安徽省人體科學學生組的組長。當時我們幾個學生（主要是生物系與物理系的本科生，只有我一個是研究生）發現了大量的超自然的現象。但是，我們當初就和現在的很多對科學缺乏了解的人一樣，抱着“沒有科學解釋不了的，只有科學還沒有解釋的”信念，不承認那些現象是超自然的現象，認為那些只是科學一時還沒有解釋的自然現象而已，而我們的興趣也正是要找到認識這些現象的科學方法。但是，真正的科學家在那個時候就認識到那些現象其實是超自然的現象。我們當時聽說我們的副校長方勵之承認那些人體特異的現象是真實的，這對我們來說是一種很大的鼓勵，於是我們幾個人就去找方勵之， 想從他那裡得到一些經費。但是，他當時的答覆讓我至今仍然記憶猶新。他說，第一他承認那些現象是真實的；第二，他不會給我們錢，因為科技大學是搞科學的，而那些現象是屬於靈學的範疇，不屬於科學研究的對象。當時我們幾個人沒有一個聽懂了他說的是什麼。直到12年以後我成為了基督徒才慢慢地理解了方勵之教授當初所說的這番話的意義。。。。。。