摩西出生在一個祭司的家庭里，他的父母都是利未人。

摩西出生的時候，埃及法老頒布了一個命令，吩咐希伯來的接生婆將出生的男嬰殺死，後來乾脆就直接吩咐將所有的男嬰丟進河裡淹死。法老的這個命令很奇怪，乍看之下是害怕以色列人繁衍眾多，出埃及記1:10，1:12，1:22。但實際上，法老的這個命令是直接針對摩西的，是要將摩西扼殺於搖籃之中，有些類似於希律王為了毀滅耶穌基督，就下令將伯利恆境內的兩周歲以內的男嬰殺掉一樣，馬太福音2:16。

法老的命令是針對摩西，依據有三個。第一，這個命令是在摩西出生前不久才頒布的。摩西有一個大他三歲的哥哥亞倫，在亞倫出生的時候，還沒有這個命令，因此亞倫得以存活。第二，這個命令是對希伯來的兩個接生婆說的。那個時候以色列的人口有六十萬，這兩個接生婆的行為對以色列的總人口不會產生什麼影響。第三，以色列的總人口有六十萬，不可能只有兩個接生婆。即使是以居住在希伯來的以色列人計，加上居住在希伯來的埃及人，也不止兩個接生婆。命令只是對希伯來的這兩個接生婆說，目標非常明確，就是摩西。

但接生婆並沒有遵從王命，摩西的媽媽也沒有遵從王命。媽媽見摩西非常俊美，就將摩西藏了三個月，後來不能再藏，就將摩西放在一個蒲草箱裡，擱在河邊的蘆荻中，又吩咐摩西的姐姐米利暗遠遠地看着。《希伯來書》說，摩西的父母因着信，將摩西藏了三個月，並不怕王命，希伯來書11:23。護犢之心乃是人之常情，父母保護孩子免受傷害是出於本能，摩西的媽媽將摩西藏起來以免被王命所害，何以說是本着信才會這樣做呢？媽媽也知道法老是針對摩西的，並且知道摩西的特殊使命。

這時，法老的女兒來河邊洗澡，恰巧就見到了摩西，容貌俊美，雖然知道是希伯來人的孩子，公主還是吩咐婢女，將摩西收為己有。法老想要摧毀的人，現在卻神奇地成了法老女兒的養子。

更為神奇的是，摩西的姐姐米利暗看到這一切，就走近前來，自告奮勇地要為摩西尋一個希伯來婦人乳養摩西。公主同意了。因此，摩西還是和他的媽媽在一起，並沒有分離，並且還多了一個埃及王子的身份。摩西長大後，就被帶進埃及王宮，接受王室的教育。以色列祭司的血統和埃及王室的教育，為將來摩西的使命奠定了堅實的基礎。